分液漏斗振蕩器被用于分離不溶混液體，當將兩種不混溶的液體放入分液漏斗振蕩器中時，可以進行分層，并看到兩層液體，較稠密的溶劑將呈現在底層，鹵化溶劑比水密度大，而非鹵化溶劑的密度低于水，如果不確定哪一層是哪一層，可以加一滴水，看看水能融入到哪一層，那么如何使用分液漏斗振蕩器？
在進行萃取之前，應檢查分液漏斗，考慮塞子適合與否，活塞裝配是否正確，會不會有泄露，分液漏斗有沒有裂縫或鋒利的邊緣，是否能裝下最夠的不溶混液體，完成檢查后就可以進行萃取，這里以碘從水溶液中萃取到二氯甲烷中的實施為例，碘雖然微溶于水溶液，但更易溶于二氯甲烷，當含有碘的水溶液與二氯甲烷接觸時，碘遷移到二氯甲烷層中，水溶液中的碘呈褐色，而二氯甲烷是無色液體，由于二氯甲烷是揮發性溶劑，該萃取應在通風地方進行。
首先，將碘水溶液置于分液漏斗中，并將少量二氯甲烷倒入其中，在將一部分二氯甲烷加入分液漏斗中，開啟分液漏斗振蕩器輕輕搖動漏斗，當面對揮發性溶劑時，需要偶爾將氣體排出分液漏斗，通過將倒置的漏斗指向空曠區域并打開旋塞來完成此操作。
接著，將分液漏斗放回到指環架并讓各層分離，大部分碘已經被萃取到二氯甲烷中，水層會變成淺棕色，而二氯甲烷層中的碘略帶紫色，取下塞子，將下層通過旋塞排入制定容器中，上層應保留在分液漏斗中。
為了提取額外的碘，可以通過向含有水層的分液漏斗振蕩器中再次加入二氯甲烷來重復步驟，也可以進行額外的提取，直到從水層中除去大部分碘，對于這種情況，是執行三次提取過程。
二氯甲烷現在幾乎含有全部碘，而水層中僅剩下少量的碘，如果要提取的溶液在頂層，那么每次提取過程中，不必從分流漏斗振蕩器中取出，而如果是在底層，則需要采用稍微不同的程序，將底層從分液漏斗中排出到干凈的容器中，在將頂部排入不同的容器中，在將底層倒回漏斗并繼續使用分液漏斗振蕩器重復提取過程。
